Součástí činnosti zoologické zahrady je i vzdělávací, studijní a vědecká činnost. Tyto funkce v krokodýlí zoo jsou a budou plněny především v zoologickém muzeu, které vzniká současně se zoo a také na základě sbírky provozovatele zoo.
Původní záměr sbírat osteologické preparáty, zejména pak lebky a celé kostry krokodýlů se postupem doby rozrostl na všechny obratlovce. Proto nyní sbírka obsahuje více než 1200 exponátů, mnohdy kompletních systematických skupin obratlovců, např. kočkovité šelmy, medvědi, sloni, nosorožci, zoborožci a další. Zlomek ze sbírky je vystaven v zoo, větší část je v depozitu. Předpokládáme, že kompletní sbírka bude vystavena jako součást zoo do konce roku 2010.