Provozovatel Krokodýlí ZOO Protivín chová dva páry krokodýla filipínského již od roku 2003. Zvířata jsou však neznámého původu, nebyla proto zatím přijata do záchranného chovu těchto krokodýlů. Zástupci zoo letos v únoru uskutečnili expedici na Filipíny, kde se setkali s mnohými autoritami ochranu filipínské přírody. Navštívili několik chovatelských zařízení nejen na krokodýly, včetně Silimanské univerzity (zde byl v 80.-tých letech minulého století Crocodylus mindorensis poprvé v zajetí rozmnožen) a Crocodile Farming Institut na Palawanu. Zoo se při této návštěvě stala podporovatelem filipínské biodiverzity, když zafinancovala výstavbu nových voliér na chov ohrožených filipínských zoborožců v Kabankalan rescue center of DENR.
Výsledkem jednání nejen na Filipínách byl podpis dohody o chovu krokodýla filipínského v rámci Phllipine Crocodile Breeding Programm se zástupci partnerské zoo a filipínského environmentálního ministerstva – DENR. V říjnu letošního roku se pak uskutečnil oficiální dovoz dospělého samce a tří stejně starých samic krokodýla filipínského do protivínské zoo, která se tak stala účastníkem záchranného chovu tohoto velmi ohroženého druhu, který se spolu s gaviálem indickým považuje za nejohroženější druh krokodýla na světě.
V současné době chová protivínská zoo největší skupinu krokodýlů filipínských v Evropě.